اضافه شدن دو نوکلئوتید

حذف نوکلئوتید

۳۱

حذف سه نوکلئوتید

حذف نوکلئوتید

۴۰

حذف سه نوکلئوتید

حذف نوکلئوتید

۴۱

حذف سه نوکلئوتید

شکل ۳- ۲۲ بخشی از کروماتوگرام ژنوتیپ شماره ۹ که تکرار سه نوکلئوتید تیمین را در محل بازهای
شماره ۱۲۲ الی ۱۲۴ نشان می­دهد.
انوع دیگری از موتاسیون­ها نیز در این قطعه یافت شده است که مشخصات آن­ها در جدول ۳- ۲۴ نشان داده شده است.
جدول ۳- ۲۴ تعداد انواع موتاسیون­های نوکلئوتیدی در قطعات تکثیری پرایمر HKT1-2

تعداد بازهای موتانت یافته

تعداد مکان­های ژنی حامل موتاسیون

تعداد موتاسیون هموزیگوس در منطقه کد کننده ژن

تعداد کل بازهای تجزیه شده در ۹۶ ژنوتیپ

۱۴۳۰ باز

۱۱۰ مکان

۹۰ موتانت

۳۹۸۴۶ باز

۳-۹-۲-۲ نقشه هضم آنزیمی قطعه تکثیری پرایمر HKT1-2
نقشه هضم آنزیمی قطعه تکثیری پرایمر HKT1-2 در شکل ۳- ۲۳ نشان داده شده است. این نقشه نشان می­دهد که قطعه تکثیری پرایمر HKT1-2 صرفاً در یک مکان (نوکلئوتید شماره ۳۱۰) توسط آنزیم EcoRI برش داده می­ شود. از مجموع ۱۴۳۰ باز موتانت یافت شده در این قطعه در ۹۶ ژنوتیپ آزمایشی (جدول ۳- ۱)، مشخص گردید که یک باز دقیقاً در محل برش این آنزیم یعنی در محل نوکلئوتید شماره ۳۱۰ واقع گردیده است. موتاسیون ایجاد شده در این باز، شامل تبدیل آدنین به تیمین بوده که موجب تبدیل اسید آمینه آرژنین به سرین می­گردد. بنابراین این محل هضم آنزیمی دارای اهمیت بسیار زیادی برای مطالعه این موتاسیون می­باشد.

شکل ۳- ۲۳ نقشه هضم آنزیمی قطعه تکثیری پرایمر HKT1- 2
۳-۹-۳ آنالیز قطعه تکثیری پرایمر HKT1-3
قطعه تکثیری پرایمر HKT1-3 نیز مانند دو قطعه قبلی به طول bp 560 بوده و با هم پوشانی چند ده باز از قطعه ما قبل خود برای تکثیر قسمت سوم توالی کامل بیان شده ژن HKT1 مورد استفاده قرار گرفته است. توالی نوکلئوتیدی این قطعه در شکل ۳- ۲۴ نشان داده شده است. این قطعه حامل انواع موتاسیون­های نوکلئوتیدی بوده که مشخصات آن­ها در بخش­های بعدی آورده شده است.
۱GCAACTTATTGTTCCCTCTCTTCCTTAGGTTACTGGTATGGTTCCTGGGGAGGCTCACAA
۶۱AGGTGAAGGAGCTGCGGCTCATGATCAAGAATCCAGAGGAAGTGCATTTTGGTAATCTGC
۱۲۱TTCCTAGGTTGCCGACTGTGTTTCTCTCCTCGACAGCCATTGGCCTTGTAGCAGCTGGGG
۱۸۱TCACAATGTTCTCCGCTGTTGATTGGAATTCTTCCGTGTTTGATGGCCTCAGCTCTTATC
۲۴۱AGAAGGCTGTCAATGCATTCTTCATGGTGGTGAATGCAAGGCACTCAGGGGAGAATTCCA